دوره شبیه‌سازی دینامیک مولکولی

شبیه سازی دینامیک مولکولی (Simulation Dynamics Molecular) روشی وابسته به کامپیوتر است که در آن، با بررسی خواص میکروسکوپی به خواص ماکروسکوپی سیستم مورد بررسی دست می‌یابیم. شبیه سازی های کامپیوتری به منظور به دست آوردن خواص مجموعه ای از مولکول‌ها بر اساس ساختار و برهمکنش های میکروسکوپی بین مولکول ها استفاده می شوند. یکی از روش های تکنیک شبیه سازی کامپیوتری، دینامیک مولکولی است. شبیه سازی‌ها به عنوان پلی بین مقیاس های طول و زمان میکروسکوپی و جهان ماکروسکوپی آزمایشگاه عمل می کنند.

از مهمترین مطالعات در نیم قرن اخیر، توضیح ساختار و عملکرد مولکول های بزرگ زیستی است. از زمانی در این زمینه مطالعاتی ، پیشرفت حاصل شد که واتسون و کریک توانستند، از مولکولDNA، ساختار سه بعد ی ارائه دهند.

در این گونه مطالعات، معادله ی حرکت نیوتون برا ی تمامی ذرات (اتم های) برهم کنش کننده ی یک سیستم حل می شود. نیروهای مورد نیاز برای حل این معادلات از تابع پتانسیل به دست می آیند . معادله ها به طور همزمان و در بازه های زمانی کوچک حل می شوند. سیستم برای مدت زمانی مشخص و در دما و فشار ثابت مورد مطالعه قرار می گیرد و موقعیت ذرات بر حسب زمان به عنوان خروجی این محاسبات خواهد بود که به آن مسیر(trajectory) سیستم گفته می شود. بدین ترتیب وضعیت سیستم در لحظه ی بعدش قابل پیش بینی خواهد بود. پس از تغییرات اولیه معمولا سیستم به مرحله پایدار یا تعادل می رسد. با میانگین گرفتن از مسیر سیستم بسیاری از خواص ماکروسکوپی سیستم را می توان به عنوان خروجی این مطالعات به دست آورد. استفاده از حل عددی معادله حرکت نیوتون برای بررسی مسیر سیستم به معنای استفاده از مکانیک کلاسیک برای توصیف حرکت اتم ها است.

مدرس دوره : آقای دکتر امیر معبودی

• دکترای فرآوری مواد معدنی
• تخصص مدل سازی و شبیه سازی

سر فصل ها:

• آشنای مقدماتی با شبیه سازی دینامیک مولکولی
• روش ساخت مدل سیستم
• تبدیل مدل اولیه سیستم به دیتا فایل
• نوشتن اینپوت فایل برای لمپس
• تحلیل نتایج شبیه سازی

زمان برگزاری دوره :

۲۱،۲۱۲،۲۸،۲۹ اردیبهشت ماه ۱۴۰۱

ساعت ۹ صبح الی ۱۳ ظهر

دوره بصورت آنلاین و در بستر اسکای روم برگزار خواهد شد.

هزینه ثبت نام در دوره:

• دانشجویان دانشگاه صنعتی سهند: ۲۰۰ هزار تومان
• دانشجویان سایر دانشگاه ها: ۳۰۰ هزار تومان

راه ارتباطی جهت ثبت نام :

برای ثبت نام به آیدی تلگرامی زیر پیام دهید: @aylin_adhami